Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20878L7N244 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms