Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top6blJ3QMY9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top6blJ3QMY9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms