Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp994J3QM38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp994J3QM38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms