Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms