Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34c3J3QJW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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