Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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