Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms