Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms