Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubgcp6G5E8P0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms