Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SprtnG3X912 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms