Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5160F8VPN3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms