Protein–RNA interactions for Protein: F7AEC7

Gm2832, Predicted gene 2832 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2832F7AEC7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2832F7AEC7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2832F7AEC7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms