Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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