Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Crocc2F6XLV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms