Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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