Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef5E9Q7D5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms