Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtproE9Q612 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms