Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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DspE9Q557 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DspE9Q557 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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