Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms