Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd1E9Q3H4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms