Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms