Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms