Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcom1E9PZ54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gcom1E9PZ54 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms