Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd1aE9PYH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd1aE9PYH6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms