Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms