Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms