Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms