Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms