Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga1E1U8D0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga1E1U8D0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms