Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms