Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms