Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5930D3Z257 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms