Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms