Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf217D3YYI7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms