Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47eD3YWC7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam47eD3YWC7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms