Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc5C3VPR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms