Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms