Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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