Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700006A11RikB9EHI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700006A11RikB9EHI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms