Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms