Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms