Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apol7aB2RT54 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apol7aB2RT54 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms