Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms