Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms