Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H60cB1B213 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms