Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms