Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms