Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf2A3KGV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms