Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms