Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga8A2ARA8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms